1963年生于宜兴，1980年高中毕业后进宜兴紫砂工艺厂，得丁亚平的悉心指导。1990年受聘于宜兴紫砂五厂带徒传艺。

1992年至1993年进中央工艺美术学院（今清华大学美术学院）紫砂陶瓷造型设计系学习，毕业考核作品“欲寿壶”“相爱壶”被中央工艺美术学院收藏。

2001年设计制作的《申奥纪念壶》在北京第一届全国陶瓷艺术设计展览中入选并收藏，同年12月该壶在上海第三届中国美术精品博览会获优秀奖。2002年在苏州举办的中国茗茶博览会上《田园情趣》组合茶具获中国工艺美术优秀作品银奖，同年11月《宝葫芦壶》获江苏省陶瓷行业协会评选三等奖。2004年考入江苏商学院工美大专班学习，2006年10月作品《顶天立地》容获第八届全国陶瓷评比创新设计三等奖。

2010年5月，“地曲壶”“福禄寿壶”“宝葫芦竹壶”受邀在上海世博会联合国馆展出并被永久收藏。12月，“青梅竹马提梁壶”在第九届全国陶瓷艺术与设计创新评比中获优秀奖。

2013年创建“吴风清韵紫砂文化艺术研究所”。太湖流域本属吴地，故名“吴风”，暗合吴芳娣姓氏。“吴风清韵紫砂文化艺术研究所”占地较广，炼泥、制壶、烧成设备一应俱全，吴芳娣可以亲自掌控所有环节。院内紫砂泥矿石堆积如山，中央电视台“走遍中国”栏目组多次探访该研究所。

作品被台湾地区政治家宋楚瑜和中央电视台节目主持人毕福剑收藏。毕福剑为吴芳娣题写“香兰雅室”匾额。

吴芳娣曾与中国美术家协会主席刘大为、国家画院画家满维起合作制壶。

2001年评为助理工艺师；2008年被评为国家级工艺美术师；2013年被评为国家级高级工艺美术师。

2016年12月受邀参加第七届阿联酋“谢赫扎耶德文化遗产节”宜兴紫砂展，参展作品：《清风提梁壶》、《小圆竹壶》。